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Blog - posts for May 2023

May 24 2023

Borealis upgrade to version 5.13

Article de blogue en français ici 

Borealis upgraded to version 5.13 on May 24, 2023. 

This upgrade brings several new features, including:

  • New DDI import scripts and changed Alternative Title field to be repeatable to support the Odesi migration*
  • Improved French translations for menus and hover text*
  • Metadata fields “Production Location” is now repeatable, facetable, and enabled for advanced search [expanded below]
  • Additional support for NetCDF and HDF5 file detection  [expanded below]
  • New support for Electronic Lab Notebooks .eln file format detection  [expanded below]
  • Geospatial Search through API  [expanded below]
  • Schema.org improvements to improve compliance
  • Bug fixes and improved security and performance

* = includes contributions from Borealis team

To test these features, feel free to use our demo sandbox environment which was upgraded on May 12.

Full details about the new features and changes can be found in the IQSS GitHub Release page for 5.13 (English only). Please note that not all of the features available will be enabled in Borealis.

Please reach out if you have any questions or feedback.

Metadata field “Production Location” is now repeatable, facetable, and enabled for advanced search

What is it?

Depositors can now enter multiple instances of the metadata field "Production Location" in the citation metadata block. Additionally, this field now appears on the Advanced Search page and can be added to the list of search facets.

What is the use-case?

In alignment with similar metadata fields, this update allows depositors to define multiple instances of the “Production Location” fields, and also allows users to refine searches based on the content in the field and use the field in the Advanced Search option. 

How do I access this feature?

When entering metadata in the main citation metadata block, click the plus sign to add the multiple instances of the field.

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Support for NetCDF and HDF5 file detection

What is it?

Previously, the Dataverse software detected NetCDF and HDF5 files based on the file extension. With this upgrade, NetCDF and HDF5 files are now detected based on their content to better support the deposit, sharing, and previewing of these file types. Additionally, the Dataverse software will attempt to extract metadata in NcML (XML) format and save it as an auxiliary file.

What is the use-case?

NetCDF (Network Common Data Form) is a machine independent data format and an international standard of the Open Geospatial Consortium. 

HDF (Hierarchical Data Format) is an open source file format that supports large and complex data.

How do I access this feature?

Upon uploading these file formats, the software will detect the format. Note: Older HDF4 files are only detected based on the file extension. Stay tuned for more details about NetCDF and HDF file previewers.

File list showing file-detection of HDF and NetCDF files.

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Support for .eln (Electronic Laboratory Notebooks) file detection

What is it?

The Dataverse software now detects .eln file format to better support the deposit, sharing, and previewing of Electronic Lab Notebooks.

What is the use-case?

The ELN file format was developed to improve interoperability among different ELN software. This archive format allows for the import/export of research data, such as experimental results, protocols, descriptions, templates, etc.

How do I access this feature?

Uploading .eln files are detected in the system. Stay tuned for more details about the file previewers.

File list showing file-detection of an ELN file

Geospatial Search through API

What is it?

Geospatial search is supported via the Search API through two new parameters: geo_point and geo_radius.

What is the use-case?

For researchers who would like to search for datasets with a specific geospatial reference. 

How do I access this feature?

The metadata fields that are geospatially indexed are “West Longitude,” “East Longitude,” “North Latitude,” and “South Latitude,” which can be found in the “Geographic Bounding Box” field in the “Geospatial Metadata” block.

The documentation for the Search API provides details about the new geo parameters. The geo_point parameter supplies the latitude and longitude and the geo_radius supplies the radial distance in kilometers from geo_point.

An example search using the browser:

https://demo.borealisdata.ca/api/search?q=*&geo_point=42.3

, -71.1&geo_radius=1.5

The search will result in the JSON output in the browser that will show the results (as displayed in the screenshot below).

Screenshot of JSON output of the API command

 

May 24 2023

Mise à niveau de Borealis vers la version 5.13

Blog post in English here 

Borealis a été mis à niveau vers la version 5.13 le 24 mai. La mise à niveau comporte de nombreuses nouvelles fonctionnalités, y compris :

  • Nouveaux scripts d’importation DDI et changements aux titres alternatifs qui deviennent répétables pour supporter la migration Odesi*
  • Amélioration de la traduction française pour les menus et le texte en survol*
  • Champ de métadonnées « Lieu de production » maintenant répétable, repérable par facette et activé dans la recherche avancée [voir ci-dessous]
  • Soutien pour la détection de fichiers NetCDF et HDF5 [voir ci-dessous]
  • Soutien pour la détection du format de fichiers Electronic Lab Notebooks .eln [voir ci-dessous]
  • Recherche géospatiale par API [voir ci-dessous]
  • Amélioration à Schema.org pour aux fins de conformité
  • Corrections de bogues et améliorations à la sécurité et à la performance

* = avec des contributions de l’équipe de Borealis

Pour tester ces fonctionnalités, vous pouvez utiliser notre environnement bac à sable qui a été mis à niveau le 12 mai.

Tous les détails de ces nouvelles fonctionnalités et de ces changements se trouvent sur la page des notes de version 5.13 GitHub d’IQSS (en anglais uniquement). Prenez note que les fonctionnalités décrites ne seront pas toutes activées dans Borealis.

N’hésitez pas à communiquer avec nous pour toute question ou tout commentaire.

Champ de métadonnée « Lieu de production » maintenant répétable, repérable par facette et activé dans la recherche avancée

Qu’est-ce que c’est?

Lors du dépôt, il est maintenant possible de saisir plusieurs instances du champ de métadonnées « Lieu de production » dans le bloc de métadonnées de la référence bibliographique. De plus, ce champ apparaît maintenant sur la page Recherche avancée et peut être ajouté à la liste des facettes de recherche.

Quel est le cas d’utilisation?

Comme pour les champs de métadonnées similaires, cette mise à jour permet de définir plusieurs instances des champs « Lieu de production » et permet également d’affiner les recherches en fonction du contenu du champ et d’utiliser le champ dans l’option Recherche avancée.

Comment accéder à cette fonctionnalité?

Lors de la saisie des métadonnées dans le bloc de métadonnées de la référence bibliographique, cliquez sur le signe plus pour ajouter d’autres instances du champ.

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Soutien pour la détection de fichiers NetCDF et HDF5

Qu’est-ce que c’est?

Auparavant, le logiciel Dataverse détectait les fichiers NetCDF et HDF5 par leur extension. Avec cette mise à niveau, les fichiers NetCDF et HDF5 sont maintenant détectables par leur contenu pour mieux soutenir le dépôt, le partage et l’aperçu des fichiers. De plus, le logiciel Dataverse tentera d’extraire les métadonnées en format NcML (XML) pour les enregistrer dans un fichier auxiliaire.

Quel est le cas d’utilisation?

NetCDF (Network Common Data Form) est un format de données indépendant de la machine et une norme internationale de l’Open Geospatial Consortium. 

HDF (Hierarchical Data Format) est un format de fichier ouvert qui prend en charge des données volumineuses et complexes.

Comment accéder à cette fonctionnalité?

Lors du téléversement de ces formats de fichiers, le logiciel détectera le format. Remarque : Les anciens fichiers HDF4 ne sont détectés qu’en fonction de l’extension de fichier. Plus de détails sur l’aperçu des fichiers NetCDF et HDF seront communiqués prochainement.

Liste de fichiers avec les fichiers HDF et NetCDF détectés.
 

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Soutien pour la détection du format de fichiers .eln (Electronic Laboratory Notebooks)

Qu’est-ce que c’est?

Le logiciel Dataverse détecte désormais le format de fichier .eln pour mieux prendre en charge le dépôt, le partage et l’aperçu des cahiers de laboratoire électroniques.

Quel est le cas d’utilisation?

Le format de fichier ELN a été développé pour améliorer l’interopérabilité entre les différents logiciels ELN. Ce format d’archive permet l’importation/exportation de données de recherche, telles que des résultats expérimentaux, des protocoles, des descriptions, des modèles, etc.

Comment accéder à cette fonctionnalité?

Les fichiers .eln téléversés sont détectés dans le système. Plus de détails sur l’aperçu des fichiers seront communiqués prochainement.

Liste de fichiers avec le fichier ELN détecté.

Recherche géospatiale par API

Qu’est-ce que c’est?

La recherche géospatiale est prise en charge par l’API de recherche grâce à deux nouveaux paramètres : geo_point et geo_radius.

Quel est le cas d’utilisation?

Pour les personnes qui souhaitent rechercher des ensembles de données avec une référence géospatiale spécifique.

Comment accéder à cette fonctionnalité?

Les champs de métadonnées indexés géospatialement sont « Longitude ouest », « Longitude est », « Latitude nord » et « Latitude sud », qui se trouvent dans la section « Zone de délimitation géographique » du bloc « Métadonnées géospatiales ».

La documentation de l’API de recherche (en anglais) fournit des détails sur les nouveaux paramètres géographiques. Le paramètre geo_point fournit la latitude et la longitude et le geo_radius fournit la distance radiale en kilomètres depuis geo_point.

Un exemple de recherche à l’aide du navigateur :

https://demo.borealisdata.ca/api/search?q=*&geo_point=42.3

, -71.1&geo_radius=1.5

La recherche produira la sortie JSON dans le navigateur qui affichera les résultats (comme affiché dans la capture d’écran ci-dessous).

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